Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG6Q9BXT2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms