Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP5Q9BXF6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms