Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms