Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NICN1Q9BSH3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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