Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM7Q9BQ49 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM7Q9BQ49 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms