Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN18Q99952 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms