Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5SQ99766 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5SQ99766 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms