Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3R4Q99570 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3R4Q99570 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3R4Q99570 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3R4Q99570 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms