Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDK5RAP2Q96SN8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms