Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRPK1Q96SB4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms