Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R9BQ96SB3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R9BQ96SB3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms