Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms