Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms