Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC43Q96MW1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms