Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL15Q96M94 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms