Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKNOX2Q96KN3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms