Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms