Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFRP2Q96HF1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms