Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms