Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIRT1Q96EB6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SIRT1Q96EB6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms