Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMD3Q96D46 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms