Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRUQ92729 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRUQ92729 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRUQ92729 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRUQ92729 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRUQ92729 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRUQ92729 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRUQ92729 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRUQ92729 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms