Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTAQ92696 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RABGGTAQ92696 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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