Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
RB1CC1Q8TDY2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RB1CC1Q8TDY2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms