Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NUP35Q8NFH5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NUP35Q8NFH5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NUP35Q8NFH5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NUP35Q8NFH5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NUP35Q8NFH5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NUP35Q8NFH5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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