Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC197Q8NCU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms