Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms