Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC63Q8NA47 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC63Q8NA47 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms