Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms