Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLX4Q8IY92 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms