Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM25Q86YD3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms