Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPA1Q7RTP0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPA1Q7RTP0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms