Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HS2ST1Q7LGA3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms