Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC80Q76M96 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms