Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMUB2Q71RG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms