Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf39Q6ZRI6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf39Q6ZRI6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms