Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFXL1Q6ZNB6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms