Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CASC2Q6XLA1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CASC2Q6XLA1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms