Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCBE1Q6UXH8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCBE1Q6UXH8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms