Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms