Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms