Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms