Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms