Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS3Q68E01 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms