Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF18Q5VWM3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF18Q5VWM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms