Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF38BQ5VTL8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms