Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXDC1Q5TGL8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms