Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC183Q5T5S1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms