Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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