Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR44Q5JSH3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms